程式主畫面有標準的下拉式選單( Pull-down Menu )，有 File、Edit、View、Layout、Tools、Help 等，其中 Edit、View 與 Tools 是用來控制繪圖區的功能，內容請參閱繪圖區的說明，以下分項介紹File、Layout 以及 Help。

File 可以新增、儲存、讀取專案檔（副檔名為 .vsn），程式內所有模組元件的連結，參數設定，繪圖設定等均儲存於專案檔內。儲存選項可以選擇是否要儲存所有元件的計算結果，選擇「是」，則下次開啟專案時，無須重新計算可將每個元件的計算結果載入並繪圖。

若選擇「否」，則下次開啟專案時，所有元件將重新計算。File 選單內的選項 Close / Close All 可關閉全部的專案。

File 中的選項 Load Macro 與 Save Macro 為 Visual Signal 專業版的功能，作用是可以將常使用到的訊號處理步驟儲存為巨集 (Macro)，讓使用者在不同的專案中快速、方便地建立特定的計算流程與元件設定，無須再重新建立、連結與設定各元件。巨集的操作方法請參閱巨集的說明文件。

Tool 中有 Preference 設定，幫助使用者設定 Visual Signal 的執行預設值，其中詳細內容請參考1.6 偏好設定。

Help 提供了 Visual Signal 的相關使用文件，其中 Online Reference Guide 幫助使用者了解元件演算法，如何應用於實際訊號。Online External Module Reference 包括 API XML Protocol 、ExternalBase Class Library，API XML Protocol 提供 Visual Signal 與外部 DLL 的溝通協定，ExternalBase Class Library 解說這個 Library 中各種函數屬性、回傳資料型態等，幫助使用者進行開發。License Manager 可以進行 License 管理、移除、新增等。